杭州复旦医院是以国家二胎政策开放，儿童就诊基数大增为前提，以上海复旦大学副校长、上海复旦医院院长桂永浩提出的生物-心理-社会-环境的儿科诊疗新模式为诊疗理论，由上海复旦医院专家发起，得到包括杭州市第七人民医院、浙江省中医院、南京医科大学附属脑科医院、中山大学公共卫生学院、上海交通大学医学院精神医学教研室、杭州小儿成长发育研究院、西南医院在内的全国知名医院专家大力响应，经国家有关部门政策扶持、由公益组织募资筹办，从一切为了孩子、缓解儿科就诊压力出发，于2015年面向全社会开诊的一所重点专注于抽动症、多动症、遗尿症、自闭症、智力低下、发育迟缓等发育行为疾病、具有研究性质的专科医院。
　　杭州复旦医院是浙江省首家“医教一体”儿童专科医院，传承上海复旦医院“一切为了孩子”建院宗旨，依托复旦优势资源，实现专家、技术、疗法等优势资源上的整合，以儿童“发育行为”疾病为专注领域，融合现代国内外儿科前沿医学技术，全面导入国际先进医疗服务理念和管理模式，集“测、评、医、导、训”医教一体，融入中医、西医、心理、康复、特教多学科，为儿童发育行为疾病整体治疗与康复开辟了崭新途径。
　　杭州复旦医院以立足杭州，服务江浙，辐射全国为发展战略，力求从医疗科技、康复教育两个层面为患儿提供身心健康的保障与呵护。因杭州复旦医院是全国首家与上海复旦医院实现战略整合的专科医院，因此也被当地民众誉为是“家门口的上海复旦医院”。
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